SylabUZ

Wygeneruj PDF dla tej strony

PW5b - Profilowanie genomów i transkryptomów - opis przedmiotu

Informacje ogólne
Nazwa przedmiotu PW5b - Profilowanie genomów i transkryptomów
Kod przedmiotu 13.9-WB-BTP-Profil.ge.-S18
Wydział Wydział Nauk Biologicznych
Kierunek Biotechnologia
Profil ogólnoakademicki
Rodzaj studiów pierwszego stopnia z tyt. licencjata
Semestr rozpoczęcia semestr zimowy 2018/2019
Informacje o przedmiocie
Semestr 3
Liczba punktów ECTS do zdobycia 2
Typ przedmiotu obowiązkowy
Język nauczania polski
Sylabus opracował
  • dr Elżbieta Heger
Formy zajęć
Forma zajęć Liczba godzin w semestrze (stacjonarne) Liczba godzin w tygodniu (stacjonarne) Liczba godzin w semestrze (niestacjonarne) Liczba godzin w tygodniu (niestacjonarne) Forma zaliczenia
Wykład 15 1 - - Zaliczenie na ocenę
Laboratorium 15 1 - - Zaliczenie na ocenę

Cel przedmiotu

Prezentacja współczesnych metod wielkoskalowych profilowania genomów i transkryptomów oraz sposobów dokumentacji, przetwarzania i upowszechniania odpowiadającym im zbiorom danych. 

 

Wymagania wstępne

Znajomość zagadnień z zakresu biochemii, genetyki i biologii komórki.Umiejętność obsługi komputera oraz korzystania z programów komputerowych i źródeł internetowych.

Zakres tematyczny

Zależności funkcjonalne pomiędzy genomem, transkryptomem a proteomem. Współczesne definicje genu i transkryptu, poziomy regulacji transkrypcji, proces alternatywnego składania genów. Epigenetyka. Zastosowanie technologii mikromacierzy i sekwencjonowania w diagnostyce medycznej. Metagenomika w analizie różnorodności gatunkowej.

 

 

Metody kształcenia

Wykład,konsultacje,laboratoria: ćwiczenia z wykorzystaniem programów komputerowych i zasobów internetowych baz danych.

 

Efekty uczenia się i metody weryfikacji osiągania efektów uczenia się

Opis efektu Symbole efektów Metody weryfikacji Forma zajęć

Warunki zaliczenia

Wykład – pozytywna ocena z zaliczenia materiału wykładowego. Test zaliczeniowy obejmuje 40 pytań zamkniętych, czas trwania zaliczenia 60 minut. Pozytywną ocenę uzyskuje student po udzieleniu 50 % poprawnych odpowiedzi. Laboratorium komputerowe - warunkiem zaliczenia jest uzyskanie pozytywnych ocen z  przygotowania trzech sprawozdań pisemnych i jednej prezentacji multimedialnej – ocena pozytywna powyżej 50 %  punktów możliwych do uzyskania. Ocena końcowa to średnia arytmetyczna ocen cząstkowych (po 50% z części wykładowej i laboratoryjnej).

 

Literatura podstawowa

1. TA Brown. Genomy. PWN 2018

2. Charon Krystyna M.Marek Świtoński. Genetyka i genomika zwierząt. PWN 2012

 

Literatura uzupełniająca

1. Bal J. Biologia molekularna w medycynie. Elementy genetyki klinicznej. Warszawa: PWN; 2006.

2. Buchowicz J. Biotechnologia molekularna. Warszawa: PWN; 2006.

 

Uwagi


Zmodyfikowane przez dr Elżbieta Heger (ostatnia modyfikacja: 21-05-2018 12:05)