PW16b - Zastosowania mutagenezy w biotechnologii - opis przedmiotu

Informacje ogólne

Nazwa przedmiotu	PW16b - Zastosowania mutagenezy w biotechnologii
Kod przedmiotu	13.9-WB-BTP-Zast.muta.-S18
Wydział	Wydział Nauk Biologicznych
Kierunek	Biotechnologia
Profil	ogólnoakademicki
Rodzaj studiów	pierwszego stopnia z tyt. licencjata
Semestr rozpoczęcia	semestr zimowy 2018/2019

Informacje o przedmiocie

Semestr	6
Liczba punktów ECTS do zdobycia	2
Typ przedmiotu	obowiązkowy
Język nauczania	polski
Sylabus opracował	dr hab. Beata Machnicka, prof. UZ

Formy zajęć

Forma zajęć	Liczba godzin w semestrze (stacjonarne)	Liczba godzin w tygodniu (stacjonarne)	Liczba godzin w semestrze (niestacjonarne)	Liczba godzin w tygodniu (niestacjonarne)	Forma zaliczenia
Laboratorium	30	2	-	-	Zaliczenie na ocenę

Cel przedmiotu

Celem kształcenia jest przekazanie studentowi wiedzy i umiejętności dotyczących nowoczesnych technik mutagenezy białek. Student ma możliwość współpracować z grupą, wspólnie wykonywać zadania analityczne oraz brać odpowiedzialność za powierzony sprzęt.

Wymagania wstępne

Znajomość podstaw chemii i biochemii

Zakres tematyczny

1. Ćwiczenia organizacyjne, omówienie techniki ukierunkowanej mutagenezy, omówienie preparatyki ćwiczeń, wykonanie niezbędnych obliczeń i przygotowanie przez każdy zespół roztworów i buforów do ćwiczeń – 5h

2. Analiza struktury badanego białka w programie Yasara, wybranie reszt aminokwasowych do mutagnezy, przedstawienie zasad projektowania starterów i projektowanie starterów dedykowanych do mutagenezy ukierunkowanej – 5h

3. Przygotowanie komórek kompetentnych E.coli – 5h

4. Reakcja PCR przy użyciu zestawu QuikChange II Site-Directed Mutagenesis (Agilent Technologies). Transformacja ultrakompetentych komórek E.coli BL21 – 5h

5. Zakładanie hodowli nadekspresjonującej wybrane białka, wirowanie prób i liza bakterii metodą chemiczną, TAF i poprzez sonikowanie w celu degradacji komórek i ochrony badanych białek, podzielenie i zamrożenie prób – 5h

6. Rozdział białek lizatu metodą SDS PAGE – 5h

Metody kształcenia

Praktyczna praca laboratoryjna

Efekty uczenia się i metody weryfikacji osiągania efektów uczenia się

Opis efektu	Symbole efektów	Metody weryfikacji	Forma zajęć

Warunki zaliczenia

Warunkiem zaliczenia laboratorium jest obecność i uzyskanie pozytywnej oceny z kolokwium oraz sprawozdania z ćwiczeń laboratoryjnych. Ocena końcowa to średnia arytmetyczna ocen cząstkowych

Literatura podstawowa

1.„Protein structure and function”, Petsko GA, Ringe D, New Science Press Ltd

2. „Introduction to Protein Structure”, Branden C, Tooze J, Garland Publishing, Inc

Literatura uzupełniająca

1. Artykuły naukowe w języku polskim i angielskim

Uwagi

Zmodyfikowane przez dr Andrzej Jurkowski (ostatnia modyfikacja: 18-12-2018 09:11)