SylabUZ

Wygeneruj PDF dla tej strony

Biochemia białek - opis przedmiotu

Informacje ogólne
Nazwa przedmiotu Biochemia białek
Kod przedmiotu 13.6-WB-BTD-Bioch-S20
Wydział Wydział Nauk Biologicznych
Kierunek Biotechnologia / Biotechnologia farmaceutyczna
Profil ogólnoakademicki
Rodzaj studiów drugiego stopnia z tyt. magistra
Semestr rozpoczęcia semestr zimowy 2021/2022
Informacje o przedmiocie
Semestr 1
Liczba punktów ECTS do zdobycia 4
Typ przedmiotu obowiązkowy
Język nauczania polski
Sylabus opracował
  • dr Elżbieta Heger
Formy zajęć
Forma zajęć Liczba godzin w semestrze (stacjonarne) Liczba godzin w tygodniu (stacjonarne) Liczba godzin w semestrze (niestacjonarne) Liczba godzin w tygodniu (niestacjonarne) Forma zaliczenia
Laboratorium 20 1,33 - - Zaliczenie na ocenę
Wykład 15 1 - - Zaliczenie na ocenę

Cel przedmiotu

Celem wykładu jest prezentacja budowy, właściwości i funkcji wybranych białek komórkowych a także konsekwencji ich defektów molekularnych w świetle współczesnych osiągnięć nauki. Zaprezentowane zostaną stosowane aktualnie techniki i podejścia badawcze,  zasygnalizowanie kierunków rozwoju tej dziedziny nauki oraz podkreślenie jej wagi w interdyscyplinarnej przestrzeni nauk biologicznych. Celem jest także zwrócenie uwagi studenta na potrzebę rozwoju kolejnych metod badawczych oraz umiejętności właściwego rozpoznawania problemu eksperymentalnego, kreatywnego podejścia do jego rozwiązania i rzetelnej interpretacji danych.

Wymagania wstępne

Zaliczenie kursu chemii organicznej, biochemii, genetyki i biologii komórki.

Zakres tematyczny

Wykład:

1. Motywy i domeny białkowe. 

2. Aktywność biologiczna białek (wiązanie do błon biologicznych, oddziaływania białko-białko, aktywność enzymatyczna i in.).

3. Proteomika i metody w niej wykorzystywane (elektroforeza 2D, spektrometria masowa, mikromacierze i in.).

4.. Metody analizy struktury białek ( NMR, EPR, krystalografia i in.).

5. Białka komórkowe - analiza wybranych przykładów w stanach fizjologicznych i patologicznych.

 

Laboratorium:

1. Analiza białek in silico - zasoby internetowe sekwencji i struktur białkowych, danych ekspresyjnych, wizualizacji białek in vivo. Programy służące analizie białek.

2. Metody selektywnej ekstrakcji białek. 

3. Metody frakcjonowania, ocena czystości preparatów białkowych.

4. Rozdział elektroforetyczny typu SDS-Page białek glikozylowanych i glikowanych, analiza porównawcza preparatów, wykrywanie cukrów w profilach białkowych.

5. Separacja i analiza właściwości biologicznych lizozymu.

Metody kształcenia

Metoda podająca - wykład w formie prezentacji multimedialnych wsparty rycinami i krótkimi filmami instruktażowymi, przykłady rozwiązywania problemów.

Ćwiczenia laboratoryjne, praca doświadczalna z zakresu preparatyki i analizy białek, laboratorium komputerowe - ćwiczenia z wykorzystaniem zasobów białkowych baz danych i programów komputerowych dedykowanych analizie białek.

Efekty uczenia się i metody weryfikacji osiągania efektów uczenia się

Opis efektu Symbole efektów Metody weryfikacji Forma zajęć

Warunki zaliczenia

Wykład - zaliczenie końcowe przeprowadzone jest w formie pisemnej. Każdy student zobligowany jest do rozwiązania testu jednokrotnego wyboru (30 pytań). Ocena pozytywna - powyżej 60% uzyskanych punktów.

Ćwiczenia laboratoryjne: warunkiem zaliczenia jest uzyskanie pozytywnych ocen z kolokwium zaliczeniowego oraz ze wszystkich zadań przewidzianych do realizacji w ramach programu,tj.: przygotowania charakterystyki białka na podstawie dostępnych baz danych i programów komputerowych, realizacji i samodzielnego opracowania wyników w ramach 3 cykli zadań laboratoryjnych. Każdorazowo, cena pozytywna - powyżej 60% uzyskanych punktów.

Ocena końcowa z przedmiotu to średnia arytmetyczna ocen cząstkowych.

Literatura podstawowa

1. Berg J.M., J.L. Tymoczko, L. Stryer, Biochemia (wyd.IV), PWN, Warszawa, 2009.

2. Hames B.D., N.M. Hooper, Krótkie wykłady: Biochemia (wyd.III), PWN, Warszawa, 2010.

3. Doonan S., Białka i peptydy, PWN, Warszawa, 2008

Literatura uzupełniająca

1. Zgirski, R. Gondko, Obliczenia biochemiczne, PWN, Warszawa, 2010.

2. Kłyszejko-Stefanowicz L., Ćwiczenia z biochemii, PWN, Warszawa, 2011.

3.  Alberts B., D. Bray, K. Hopkin, A. Johnson, J. Lewis, M. Raff, K. Roberts, P. Walter,

4. Kraj A., A. Drabik, J. Silberring, Proteomika i metabolomika, Wydawnictwo Uniwersytetu Warszawskiego, 2010.

Uwagi


Zmodyfikowane przez dr Elżbieta Heger (ostatnia modyfikacja: 05-01-2021 09:29)