1. SylabUZ
2. Wydział Nauk Biologicznych
3. semestr zimowy 2022/2023
4. Biotechnologia - pierwszego stopnia z tyt. licencjata
5. Analiza zróżnicowania międzyosobniczego na podstawie profilu genetycznego - PW12b

Wygeneruj PDF dla tej strony

Analiza zróżnicowania międzyosobniczego na podstawie profilu genetycznego - PW12b - opis przedmiotu

Cel przedmiotu

Celem zajęć jest zapoznanie studenta z markerami genetycznymi oraz ich zastosowaniem w profilowaniu genetycznym. ponadto celem kształcenia jest przekonanie studenta o istotnej roli analiz statystycznych we wszystkich dyscyplinach współczesnej nauki. Przekazanie podstawowej wiedzy dotyczącej wykorzystania analiz statystycznych w pracy biologa, czyli testowania hipotez badawczych. Nauczenie jak planować i zakładać doświadczenia pozwalające prawidłowo opracować i interpretować wyniki pod kątem analiz statystycznych.

Wymagania wstępne

Zapisz zmiany

Wiedza z zakresu biochemii, genetyki klasycznej, znajomość podstaw matematyki z zakresu pierwszych klas szkoły średniej. Znajomość podstaw pakietu Excel.

Zakres tematyczny

Źródła DNA, metody konserwacji prób biologicznych i izolacji DNA.Główne typy  markerów genetycznych oraz ich klasyfikacja.Typy dziedziczenia.Analiza polimorfizmu sekwencji mikrosatelitarnych.Szacowanie zmienności genetycznej w populacjach.Markery molekularne w badaniach zoologicznych, botanicznych, w sądownictwie i kryminalistyce. Identyfikacja  metodami barkodingu i metabarkodingu.

Typy pomiarów w biologii. Próby i populacje statystyczne. Miary położenia – miary tendencji centralnej. Miary rozproszenia – zmienności. Testowanie hipotez. Testy różnic między średnimi. Testy nieparametryczne. Rozkład F Snedecora. Podstawy analizy wariancji. Podstawy analizy korelacji i regresji.

Metody kształcenia

podająca (w formie prezentacji multimedialnej) oraz dyskusja i pogadanka

Efekty uczenia się i metody weryfikacji osiągania efektów uczenia się

Opis efektu	Symbole efektów	Metody weryfikacji	Forma zajęć

Warunki zaliczenia

Warunkiem zaliczenia jest uczestnictwo w zajęciach, uzyskanie pozytywnej oceny z  testu końcowego oraz przygotowanie zadanego zagadnienia. Zaliczenie przeprowadzane jest w formie pisemnej. Czas trwania  60 minut. Do zaliczenia na ocenę dostateczną wymagana jest poprawna odpowiedź na co najmniej 50% punktów + 1.

 

Literatura podstawowa

1. J. R. Freeland (2008) Ekologia molekularna. PWN, Warszawa
2. M. Pilot, R. Rutkowski, A. Malewska, T. Malewski (2005) Zastosowanie metod molekularnych w badaniach ekologicznych. MIZ

3. Avise John C. Markery molekularne historia naturalna i ewolucja (2008) Wydawnictwo Uniwersytetu Warszawskiego.

4. S.B.Primose (1999) Zasady analizy genomu. WT, Warszawa

5. Łomnicki A., Wprowadzenie do statystyki dla przyrodników, PWN, Warszawa 2010.
6. Stanisz A. Przystępny kurs statystyki tom I, II i III z zastosowaniem STATISTICA PL na przykładach z medycyny StatS
7. Moczko J.A., Bręborowicz G.H., Tadeusiewicz R., Nie samą statystyką, Ośrodek Wydawnictw Naukowych ICB PAN, Poznań 2010.

Literatura uzupełniająca

1.      Artykuły w periodykach z zakresu ekologii, genetyki, ochrony środowiska.

2. Watała C., Biostatystyka – Wykorzystanie metod statystycznych w pracy badawczej w naukach biomedycznych, alfa-medica press, Warszawa 2002.

3.  Żuk B., Biometria stosowana, PWN, Warszawa 1989.

Uwagi

Zmodyfikowane przez dr Andrzej Jurkowski (ostatnia modyfikacja: 20-04-2022 14:45)