SylabUZ

Wygeneruj PDF dla tej strony

Seminarium specjalizacyjne - opis przedmiotu

Informacje ogólne
Nazwa przedmiotu Seminarium specjalizacyjne
Kod przedmiotu 13.9-WB-BMD-SS2-S-S14_pNadGenP42GC
Wydział Wydział Nauk Biologicznych
Kierunek Biologia / Biologia molekularna
Profil ogólnoakademicki
Rodzaj studiów drugiego stopnia z tyt. magistra
Semestr rozpoczęcia semestr zimowy 2017/2018
Informacje o przedmiocie
Semestr 3
Liczba punktów ECTS do zdobycia 4
Typ przedmiotu obowiązkowy
Język nauczania polski
Sylabus opracował
  • dr hab. Katarzyna Baldy-Chudzik, prof. UZ
Formy zajęć
Forma zajęć Liczba godzin w semestrze (stacjonarne) Liczba godzin w tygodniu (stacjonarne) Liczba godzin w semestrze (niestacjonarne) Liczba godzin w tygodniu (niestacjonarne) Forma zaliczenia
Seminarium 45 3 - - Zaliczenie na ocenę

Cel przedmiotu

Celem zajęć seminaryjnych z  technik biologii molekularnej w mikrobiologii jest nabycie przez studenta wiedzy teoretycznej, w wyniku czego student powinien scharakteryzować metody służące identyfikacji drobnoustrojów pochodzących z różnych środowisk, objaśnić metody amplifikacji DNA wykorzystywane w identyfikacji organizmów różnych gatunków, opisać podstawowe procesy związane z manipulacją kwasami nukleinowymi , objaśnić znaczenie ruchomych elementów genetycznych w ewolucji genomów bakteryjnych, scharakteryzować genetyczne podstawy różnorodności organizmów.

Wymagania wstępne

Znajomość podstaw biologii, chemii, biochemii i genetyki ogólnej na poziomie studiów I stopnia, mikrobiologii ogólnej i molekularnej na poziomie II stopnia studiów biologicznych. Deklaracja chęć wykonania pracy magisterskiej w Katedrze Mikrobiologii i Genetyki.

Zakres tematyczny

Podstawowe metody służące identyfikacji drobnoustrojów w różnych środowiskach. Wykorzystanie metod amplifikacji DNA w identyfikacji organizmów różnych gatunków. Wykorzystanie genu ac w identyfikacji E.coli w wodzie i glebie. Wykorzystanie sekwencji repetytywnych występujących w genomach bakterii w monitoringu różnych gatunków bakterii w różnych środowiskach. Metody genomowego fingerprintu w ocenie zróżnicowania bakteryjnej populacji w obrębie jednego i wielu gatunków. Wykorzystanie rep-PCR fingerprinting w ocenie wewnątrz-gatunkowej różnorodności na przykładzie E.coli. Zasada i wykorzystanie techniki elektroforezy pulsacyjnej PFGE w analizach polimorfizmu genomowego organizmów pro- i eukariotycznych. Występowanie i różnorodność czynników patogenności u bakterii indykatorowych dla kałowego zanieczyszczenia wody i gleby. Metody hybrydyzacji typu FISH w ocenie przeżywalności drobnoustrojów w zbiornikach wodnych.

Metody kształcenia

Metody podające - w formie prezentacji przygotowywanych przez studentów pod opieką prowadzących seminaria.

Efekty uczenia się i metody weryfikacji osiągania efektów uczenia się

Opis efektu Symbole efektów Metody weryfikacji Forma zajęć

Warunki zaliczenia

Warunkiem zaliczenia jest przedstawienie w formie prezentacji multimedialnej założeń, wyników i wniosków przygotowywanej pracy magisterskiej

Literatura podstawowa

  1.     Turner P.C., McLennan A.G., Bates A.D., White M.R.H., „Biologia molekularna, Krótkie wykłady, PWN, 2007
  2.     Krawczyk B., Kur J., Diagnostyka molekularna w mikrobiologii, Wyd. Politechniki Gdańskiej, 2008
  3.     Bal J., Badania molekularne i cytogenetyczne w medycynie, PWN, 199

Literatura uzupełniająca

       1. Brown T.A., Genomy, PWN, 2011

Uwagi


Zmodyfikowane przez dr Katarzyna Dancewicz (ostatnia modyfikacja: 23-01-2018 09:49)