SylabUZ
Nazwa przedmiotu | Seminarium specjalizacyjne |
Kod przedmiotu | 13.9-WB-BMD-SS3-S-S14_pNadGen4F4AB |
Wydział | Wydział Nauk Biologicznych |
Kierunek | Biologia / Biologia molekularna |
Profil | ogólnoakademicki |
Rodzaj studiów | drugiego stopnia z tyt. magistra |
Semestr rozpoczęcia | semestr zimowy 2018/2019 |
Semestr | 4 |
Liczba punktów ECTS do zdobycia | 12 |
Typ przedmiotu | obowiązkowy |
Język nauczania | polski |
Sylabus opracował |
|
Forma zajęć | Liczba godzin w semestrze (stacjonarne) | Liczba godzin w tygodniu (stacjonarne) | Liczba godzin w semestrze (niestacjonarne) | Liczba godzin w tygodniu (niestacjonarne) | Forma zaliczenia |
Seminarium | 45 | 3 | - | - | Zaliczenie na ocenę |
Celem zajęć seminaryjnych z technik biologii molekularnej w mikrobiologii jest nabycie przez studenta wiedzy teoretycznej, w wyniku czego student powinien scharakteryzować metody służące identyfikacji drobnoustrojów pochodzących z różnych środowisk, objaśnić metody amplifikacji DNA wykorzystywane w identyfikacji organizmów różnych gatunków, opisać podstawowe procesy związane z manipulacją kwasami nukleinowymi, objaśnić znaczenie ruchomych elementów genetycznych w ewolucji genomów bakteryjnych, scharakteryzować genetyczne podstawy różnorodności organizmów. Student powinien przygotować rozbudowany plan formy teoretycznej pracy dyplomowej i opracować wyniki eksperymentów wyznaczonych jako cele w przygotowaniu pracy magisterskiej.
Znajomość podstaw biologii, chemii, biochemii i genetyki ogólnej na poziomie studiów I stopnia, mikrobiologii ogólnej i molekularnej na poziomie II stopnia studiów biologicznych. Deklaracja chęć wykonania pracy magisterskiej w Katedrze Mikrobiologii i Genetyki.
Podstawowe metody służące identyfikacji drobnoustrojów w różnych środowiskach. Wykorzystanie metod amplifikacji DNA w identyfikacji organizmów różnych gatunków. Wykorzystanie genu ac w identyfikacji E.coli w wodzie i glebie. Wykorzystanie sekwencji repetytywnych występujących w genomach bakterii w monitoringu różnych gatunków bakterii w różnych środowiskach. Metody genomowego fingerprintu w ocenie zróżnicowania bakteryjnej populacji w obrębie jednego i wielu gatunków. Wykorzystanie rep-PCR fingerprinting w ocenie wewnątrz-gatunkowej różnorodności na przykładzie E.coli. Zasada i wykorzystanie techniki elektroforezy pulsacyjnej PFGE w analizach polimorfizmu genomowego organizmów pro- i eukariotycznych. Występowanie i różnorodność czynników patogenności u bakterii indykatorowych dla kałowego zanieczyszczenia wody i gleby. Metody hybrydyzacji typu FISH w ocenie przeżywalności drobnoustrojów w zbiornikach wodnych.
Metody podające - w formie prezentacji przygotowywanych przez studentów pod opieką prowadzących seminaria.
Opis efektu | Symbole efektów | Metody weryfikacji | Forma zajęć |
Warunkiem zaliczenia jest przedstawienie w formie prezentacji multimedialnej rozbudowanego planu założeń, jak również opracowanych wyników i sformułowanych wniosków
przygotowywanej pracy magisterskiej
1. Turner P.C., McLennan A.G., Bates A.D., White M.R.H., „Biologia molekularna, Krótkie wykłady, PWN, 2007
2. Krawczyk B., Kur J., Diagnostyka molekularna w mikrobiologii, Wyd. Politechniki Gdańskiej, 2008
3. Bal J., Badania molekularne i cytogenetyczne w medycynie, PWN, 1999.
1. Brown T.A., Genomy, PWN, 2011
Zmodyfikowane przez dr hab. Katarzyna Baldy-Chudzik, prof. UZ (ostatnia modyfikacja: 17-05-2018 16:57)