SylabUZ

Generate PDF for this page

Biological Molecules Marking Techniques - course description

General information
Course name Biological Molecules Marking Techniques
Course ID 13.9-WB-BMD-TZCzB-L-S14_gen8TQ9A
Faculty Faculty of Exact and Natural Sciences
Field of study biotechnology / Mikrobioanalityka w biotechnologii
Education profile academic
Level of studies Second-cycle studies leading to MS degree
Beginning semester winter term 2020/2021
Course information
Semester 2
ECTS credits to win 5
Course type obligatory
Teaching language polish
Author of syllabus
  • dr hab. inż. Dżamila Bogusławska, prof. UZ
  • dr hab. Beata Machnicka, prof. UZ
Classes forms
The class form Hours per semester (full-time) Hours per week (full-time) Hours per semester (part-time) Hours per week (part-time) Form of assignment
Lecture 15 1 - - Exam
Laboratory 30 2 - - Credit with grade

Aim of the course

Celem kształcenia jest przekazanie studentowi wiedzy dotyczącej nowoczesnych technik znakowania cząstek biologicznych oraz opanowanie przez studenta podstawowych technik stosowanych w znakowaniu cząstek biologicznych, ze szczególnym uwzględnieniem technik dokumentacji wyników. Student ma możliwość współpracować z grupą, organizować wspólne wykonywanie zadań oraz brać odpowiedzialność za powierzony sprzęt.

Prerequisites

Znajomość podstaw z zakresu biochemii, biologii komórki i genetyki.

Scope

Wykład Izotopowe i nieizotopowe metody znakowania kwasów nukleinowych, białek, lipidów, węglowodanów i innych substancji biologicznie czynnych. Nieizotopowe techniki frakcjonowania i znakowania makrocząsteczek biologicznych. Znakowanie in vivo, in vitro i in silico. Markery poszczególnych organelli komórkowych. Metody detekcji sygnałów po znakowaniu cząsteczek biologicznych. Techniki elektroforetyczne i immunocytochemiczne. Techniki hybrydyzacji kwasów nukleinowych. Metody Southern blot, Northern blot, mikromacierze DNA i hybrydyzacji in situ. Znakowanie plazmidów (nick translation, random priming). Znakowanie DNA na końcach. Mapy restrykcyjne. Ilościowe oznaczanie wyznakowania cząsteczek. Metody immunochemiczne. Metody radioimmunologiczne (RIA). Izotopy: 32P, 33P, 35S oraz 14C i 3H. Metody fluorescencyjne (FIA). Fluorofory. Cytometria przeływowa, FACS, technika FISH, sekwencjonowanie DNA i RNA, mikromacierze białkowe i tkankowe. Metody immunoenzymatyczne (EIA). Western blot. Metoda ELISA. Metody chemiluminescencyjne.

Laboratorium Analiza Western blot: przygotowanie białka - liza komórek; SDS-PAGE; transfer białek na membranę; blokowanie miejsc niespecyficznych; inkubacja z przeciwciałami pierwszorzędowymi i drugorzedowymi;  detekcja białek metodą chemiluminescencyjną. Sekwencjonowanie DNA (metoda Sangera); barwniki stosowane do znakowania biomolekuł; MACS Cell Separation (Miltenyi Biotec); analiza densytometryczna (Image Lab Software, Image J Software).

Teaching methods

Wykład metoda podająca: wykład informacyjny z wykorzystaniem prezentacji multimedialnych,

Laboratorium metoda podająca: pogadanka na temat stosowanych metod analitycznych, metoda praktyczna: laboratoryjna; praca analityczna z wykorzystaniem wybranych technik znakowania cząsteczek biologicznych, metod dokumentacji wyników i programów bioinformatycznych.

Learning outcomes and methods of theirs verification

Outcome description Outcome symbols Methods of verification The class form

Assignment conditions

Wykład  warunkiem zaliczenia jest uzyskanie pozytywnej oceny z końcowej pisemnej pracy zaliczeniowej, do której student jest dopuszczany na podstawie uprzedniego zaliczenia ćwiczeń. Zaliczenie pisemne trwające 60 minut. Do zaliczenia na ocenę dostateczną konieczne jest uzyskanie minimum 50% punktów.

Laboratorium warunkiem zaliczenia jest obecność i uzyskanie pozytywnej oceny z kolokwium i sprawozdań z ćwiczeń laboratoryjnych. Ocena końcowa to średnia arytmetyczna ocen cząstkowych.

Recommended reading

  1. J.M. Berg, J.L.Tymoczko, L. Stryer, Biochemia PWN 2009
  2. Berg J. M., Tymoczko J. L., Stryer L.: Biochemia. Krótki kurs. Wydawnictwo Naukowe PWN, Warszawa, 2013.
  3. L. Kłyszejko-Stefanowicz Ćwiczenia z biochemii, PWN, Warszawa, 2018.
  4. T.A. Brown Genomy PWN 2009
  5. B. Alberts, D. Bray, K. Hopkin, A. Johnson, J Lewis, M. Raff, K. Roberts, P. Walter Podstawy biolologii komórki PWN 2009
  6. S. Doonan Białka i peptydy PWN 2008

Further reading

  1. Wybrane artykuły z bieżącego piśmiennictwa naukowego (publikacji oryginalnych i przeglądowych).

Notes


Modified by dr hab. inż. Dżamila Bogusławska, prof. UZ (last modification: 28-04-2020 23:57)