SylabUZ

Generate PDF for this page

PW16b - Zastosowania mutagenezy w biotechnologii - course description

General information
Course name PW16b - Zastosowania mutagenezy w biotechnologii
Course ID 13.9-WB-BTP-Zast.muta.-S18
Faculty Faculty of Biological Sciences
Field of study Biotechnology
Education profile academic
Level of studies First-cycle studies leading to Bachelor's degree
Beginning semester winter term 2019/2020
Course information
Semester 6
ECTS credits to win 2
Course type obligatory
Teaching language polish
Author of syllabus
  • dr hab. Beata Machnicka, prof. UZ
Classes forms
The class form Hours per semester (full-time) Hours per week (full-time) Hours per semester (part-time) Hours per week (part-time) Form of assignment
Laboratory 30 2 - - Credit with grade

Aim of the course

Celem kształcenia jest przekazanie studentowi wiedzy i umiejętności dotyczących nowoczesnych technik mutagenezy białek. Student ma możliwość współpracować z grupą, wspólnie wykonywać zadania analityczne oraz brać odpowiedzialność za powierzony sprzęt.

Prerequisites

Znajomość podstaw chemii i biochemii

Scope

1.    Ćwiczenia organizacyjne, omówienie techniki  ukierunkowanej mutagenezy, omówienie  preparatyki ćwiczeń,  wykonanie niezbędnych obliczeń i przygotowanie przez każdy zespół roztworów i buforów do ćwiczeń 

2.    Analiza struktury badanego białka w programie Yasara, wybranie reszt aminokwasowych  do mutagnezy, przedstawienie zasad projektowania starterów i projektowanie starterów dedykowanych do mutagenezy ukierunkowanej 

3.    Przygotowanie komórek kompetentnych E.coli 

4.    Reakcja PCR przy użyciu zestawu QuikChange II Site-Directed Mutagenesis (Agilent Technologies). Transformacja ultrakompetentych komórek E.coli BL21 

5.    Zakładanie hodowli nadekspresjonującej wybrane białka, wirowanie prób i liza bakterii metodą chemiczną, TAF i poprzez sonikowanie w celu degradacji komórek i ochrony badanych białek, podzielenie i zamrożenie prób 

6.    Rozdział białek lizatu metodą SDS PAGE 

 

Teaching methods

Praktyczna praca laboratoryjna

Learning outcomes and methods of theirs verification

Outcome description Outcome symbols Methods of verification The class form

Assignment conditions

Warunkiem zaliczenia laboratorium jest obecność i uzyskanie pozytywnej oceny z kolokwium oraz sprawozdania z ćwiczeń laboratoryjnych. Ocena końcowa to średnia arytmetyczna ocen cząstkowych

Recommended reading

1.„Protein structure and function”, Petsko GA, Ringe D, New Science Press Ltd

2. „Introduction to Protein Structure”, Branden C, Tooze J, Garland Publishing, Inc

Further reading

1.       Artykuły naukowe w języku polskim i angielskim

Notes


Modified by dr hab. Beata Machnicka, prof. UZ (last modification: 01-05-2019 21:27)